Согласно турецким источникам, в последние годы израильские ВМС изменили свою организационную структуру с целью обеспечения безопасности запасов и мест добычи природного газа у побережья страны. В настоящее время ВМС Израиля действуют в Средиземном и Красном морях (залив Акаба) и имеют военно-морские базы в Хайфе и Ашдоде на побережье Средиземного моря, а также в Эйлате на Красном море.